Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113Q902F9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113Q902F9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113Q902F9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113Q902F9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113Q902F9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113Q902F9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113Q902F9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113Q902F9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113Q902F9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113Q902F9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113Q902F9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113Q902F9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113Q902F9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERVK_113Q902F9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERVK_113Q902F9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERVK_113Q902F9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113Q902F9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms