Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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