Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms