Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms