Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF397Q8NF99 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms