Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AGBL3Q8NEM8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms