Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3C3Q8NEB9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms