Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARRDC4Q8NCT1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARRDC4Q8NCT1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARRDC4Q8NCT1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARRDC4Q8NCT1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARRDC4Q8NCT1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARRDC4Q8NCT1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARRDC4Q8NCT1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARRDC4Q8NCT1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARRDC4Q8NCT1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARRDC4Q8NCT1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARRDC4Q8NCT1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARRDC4Q8NCT1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARRDC4Q8NCT1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARRDC4Q8NCT1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ARRDC4Q8NCT1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
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