Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH13Q8NBN7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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