Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms