Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5D6

GBGT1, Globoside alpha-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBGT1Q8N5D6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBGT1Q8N5D6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GBGT1Q8N5D6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GBGT1Q8N5D6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GBGT1Q8N5D6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GBGT1Q8N5D6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBGT1Q8N5D6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBGT1Q8N5D6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBGT1Q8N5D6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GBGT1Q8N5D6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBGT1Q8N5D6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms