Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms