Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC84Q86UT8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms