Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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