Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms