Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms