Protein–RNA interactions for Protein: Q6X9E4

FBXW12, F-box/WD repeat-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW12Q6X9E4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXW12Q6X9E4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms