Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms