Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
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