Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP4Q6PIL6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP4Q6PIL6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP4Q6PIL6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP4Q6PIL6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP4Q6PIL6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP4Q6PIL6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP4Q6PIL6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP4Q6PIL6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP4Q6PIL6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP4Q6PIL6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP4Q6PIL6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP4Q6PIL6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP4Q6PIL6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP4Q6PIL6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP4Q6PIL6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP4Q6PIL6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms