Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHBDD2Q6NTF9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms