Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPPQ6IPU0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPPQ6IPU0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPPQ6IPU0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPPQ6IPU0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPPQ6IPU0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPPQ6IPU0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPPQ6IPU0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPPQ6IPU0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPPQ6IPU0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPPQ6IPU0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPPQ6IPU0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPPQ6IPU0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms