Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ1

RPGRIP1L, Protein fantom, humanhuman

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1LQ68CZ1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPGRIP1LQ68CZ1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms