Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms