Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms