Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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C9orf116Q5BN46 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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C9orf116Q5BN46 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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C9orf116Q5BN46 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
C9orf116Q5BN46 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C9orf116Q5BN46 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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