Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms