Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBPF8Q3BBV2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF8Q3BBV2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms