Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KNOP1Q1ED39 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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