Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM187BQ17R55 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM187BQ17R55 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms