Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PFKFB3Q16875 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PFKFB3Q16875 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PFKFB3Q16875 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PFKFB3Q16875 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PFKFB3Q16875 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PFKFB3Q16875 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PFKFB3Q16875 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PFKFB3Q16875 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFKFB3Q16875 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms