Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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