Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
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FOXD1Q16676 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
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