Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FXNQ16595 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FXNQ16595 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FXNQ16595 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FXNQ16595 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FXNQ16595 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FXNQ16595 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FXNQ16595 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FXNQ16595 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FXNQ16595 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms