Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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