Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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