Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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