Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
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