Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
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NCOA1Q15788 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
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NCOA1Q15788 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCOA1Q15788 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
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