Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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EFNB3Q15768 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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EFNB3Q15768 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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EFNB3Q15768 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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EFNB3Q15768 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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EFNB3Q15768 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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EFNB3Q15768 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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EFNB3Q15768 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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EFNB3Q15768 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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