Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEBPEQ15744 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEBPEQ15744 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEBPEQ15744 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEBPEQ15744 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEBPEQ15744 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEBPEQ15744 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEBPEQ15744 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEBPEQ15744 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEBPEQ15744 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEBPEQ15744 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEBPEQ15744 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CEBPEQ15744 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEBPEQ15744 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms