Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RYR3Q15413 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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