Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRKQ15262 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRKQ15262 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
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