Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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PRKD1Q15139 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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PRKD1Q15139 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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PRKD1Q15139 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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PRKD1Q15139 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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PRKD1Q15139 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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