Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
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