Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD6Q15008 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD6Q15008 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PSMD6Q15008 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD6Q15008 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD6Q15008 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD6Q15008 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD6Q15008 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD6Q15008 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD6Q15008 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD6Q15008 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD6Q15008 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD6Q15008 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD6Q15008 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD6Q15008 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PSMD6Q15008 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD6Q15008 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD6Q15008 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD6Q15008 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD6Q15008 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD6Q15008 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD6Q15008 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD6Q15008 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD6Q15008 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD6Q15008 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD6Q15008 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD6Q15008 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD6Q15008 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD6Q15008 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD6Q15008 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD6Q15008 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSMD6Q15008 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD6Q15008 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD6Q15008 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD6Q15008 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD6Q15008 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD6Q15008 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD6Q15008 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD6Q15008 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms