Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms