Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GAPVD1Q14C86 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
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