Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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