Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSPNQ14714 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms